miRNA-Seq?MicroRNA(miRNA)是一類長度約為20-24個核苷酸長度的具有調控功能的非編碼RNA,miRNA 是生物體內一類重要的特殊分子,誘導基因沉默,參與細胞生長、發育、基因轉錄和翻譯等諸多生命活動的調控過程。通過高通量測序,可以發掘、鑒定和定量出任何物種全基因組水平的小RNA圖譜、挖掘新的miRNA分子、預測靶基因、鑒定樣品間差異表達分析。

小標題-產品優勢-中
通用性高:可對任意物種、任意大小、已知或未知的Small RNA進行序列測定,無需了解前體序列信息或二級莖環結構信息;
高精確度:有效定量表達水平跨越6個數量級的轉錄本豐度;
高靈敏度:10M Reads測序量能夠檢測稀有轉錄本;
測序平臺:一次性可獲得數百萬條序列。

小標題-技術路線-中
2-5-3 miRNA-Seq-信息分析-附圖1?小RNA測序信息分析流程圖

小標題-樣品要求-中

圖標-NGS紫-樣品-小
Total RNA
總量≥10μg
濃度≥100 ng/μl
RIN值≥6.0

圖標-NGS紫-文庫-小
50SE或75SE
10M Reads/樣本

圖標-NGS紫-測序-小
50SE或75SE
10M Reads/樣本

小標題-案例分析-中
小RNA測序研究電子香煙對人類呼吸道上皮細胞中的基因表達的影響

盡管所有形式的煙草暴露對健康都有不良影響,但電子煙暴露(eCig)的重要性尚不完全清楚。本文研究了eCig對人肺上皮細胞miRNA轉錄組的整體影響。在氣液界面分化的原代人支氣管上皮(NHBE)細胞暴露于eCig液體。將NHBE暴露于任何eCig液體導致氧化應激反應基因(包括GCLM,GCLC,GPX2,NQO1和HO-1)。 eCig液體中的煙堿的蒸發和/或尼古丁的存在與更大的響應有關。研究人員在NHBE中鑒定了eCig接觸失調的578個miRNA,以及受eCig液體汽化影響的125個miRNA,其中eCig蒸氣的尼古丁對miRNA表達影響明顯。研究人員選擇了8個miRNA(29A,140,126,374A,26A-2,147B,941和589)進一步研究。在eCig暴露后,研究人員驗證了多種miRNA(包括miR126)的表達增加。研究人員還發現在暴露后兩個miR126靶基因MYC和MRGPRX3的表達顯著降低。這些數據表明,eCig暴露影響人類肺上皮細胞中的基因表達。

2-5-3 miRNA-Seq-案例分析-附圖

eCig處理的NHBE中microRNA表達的全基因組轉錄分析

SK.Solleti, S.Bhattacharya, TJ.Mariani. et al., MicroRNA expression profiling defines the impact of electronic cigarettes on human airway epithelial cells. Scientific Reports. (2017),7:1081.doi:10.1038/s41598-017-01167-8