重大進展!貝瑞基因Bionano DLS新流程植物樣本測試結果發布

Bionano Genomics公司最新推出的DLS(Direct Labeling and Staining)技術,無需對雙鏈DNA進行酶切且無任何物理損傷,有效增加了分子長度和Label序列標簽密度,而且分析軟件的升級進一步提高了基因組圖譜的組裝長度和組裝精度,為基因組組裝帶來新的指標。

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采用DLS技術獲得完整的人類3號染色體臂

(圖片來自Bionano官網)

貝瑞基因作為Bionano Genomics公司密切合作伙伴,位列全球先進、亞洲獨家DLS試劑測試用戶,較早完成了對人類血液樣本的測試,并獲得了長達76.2Mb的基因組圖譜長度(Genome Map N50),該結果相比較于常規的BspQI和BssSI酶切標記技術(NLRS)提高了近35倍。

繼完成人類樣本的測試后,貝瑞基因的研發團隊又繼續對某高度雜合的植物樣本進行Bionano DLS新流程的研發測試。本次展示的測試產出數據經組裝獲得98條Genome Maps,Genome Map N50提升至22.978Mb與同一樣本使用BssSI和BspQI酶切標記技術的組裝結果對比,Genome Map N50提升高達17.5倍,同時伴隨著Genome Map數量的減少,Bionano DLS技術對于基因組組裝所具備的獨特優勢得以充分體現!

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貝瑞基因某植物樣本DLS標記技術測試結果

注:Quantity(Gb):數據產出;

Avg.N50(Kb)(≥150Kb):≥150Kb的分子長度N50值;

Genome Map N50 (Mb):基因組組裝Map?N50長度(兆堿基);

Number Genome Maps:基因組組裝Map條數;

人和植物樣本的優異結果,是Bionano平臺穩定性的體現,同時也是貝瑞基因標準化實驗流程的體現。而貝瑞基因對Bionano DLS技術更新的腳步不會止于此,更多物種的測試結果將會陸續呈現。

貝瑞基因作為Bionano光學圖譜技術的踐行者,自Irys系統到Saphyr系統,從NLRS標記技術到DLS標記技術,經歷了Bionano光學圖譜技術的蛻變,切身感受到了光學圖譜技術為基因組組裝指標帶來的持續提升。未來,貝瑞基因希望這一路走來的經驗能夠持續積累、不斷完善,提供更強、更快、更優質的服務!

 

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